Kiedy poszukiwania tych metali szlachetnych okazały się bezowocne, osadnicy zaczęli uprawiać żyzne ziemie, a głównymi uprawami była pszenica, pastele i pigmenty pozyskiwane z porostów. W szczególności kwitł eksport do zakładów farbiarskich do Flandrii i Anglii i zapewnił wyspie władzę, która – oprócz faktu, że hiszpańskie statki wypełnione bogactwami wykorzystywały również Hortę jako port, do którego zawijały w drodze powrotnej z kolonii w Ameryce – przyciągnęło to wielu korsarzy, a Faial był kilkakrotnie celem grabieży w XVI i XVII wieku. W tym czasie miały miejsce inne niepowodzenia, takie jak ogromna erupcja Cabeço de Fogo w 1672 r. i kilka niszczycielskich trzęsień ziemi. Jednak mieszkańcy wyspy szybko otrząsnęli się z tych niepowodzeń, również dzięki eksploatacji sąsiedniej wyspy Pico, której administracją zawsze zajmował się Faial.
W połowie XVIII wieku pierwsi amerykańscy wielorybnicy sprowadzili na wyspę tę branżę, i wielorybnictwo stało się ważnym źródłem dochodu wyspiarzy. Kolejnym filarem gospodarki wyspy była uprawa i eksport pomarańcz do 1860 roku, kiedy to grzybica zniszczyła większość plantacji pomarańczy. Kiedy położono pierwszy kabel telegraficzny z Lizbony do Horty, a następnie w 1900 roku do Nowej Szkocji w Kanadzie, Faial – a właściwie miasto Horta – zasłynęło jako ośrodek łączności telegraficznej pomiędzy Starą i Nową Szkocją. W rezultacie wiele międzynarodowych firm komunikacyjnych osiedliło się w Horta, a Faial stała się najbardziej rozwiniętą wyspą w archipelagu.